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微生物系統保存施設に保存されている藻類保存株の分類学的評価と保存株データベースの整備(平成 22年度)
Taxonomic evaluation of algal strains maintained in the Microbial Culture Collection at NIES (NIES-Collection) and upgrading of strain database

予算区分
AD 基盤ラボ
研究課題コード
0811AD001
開始/終了年度
2008~2011年
キーワード(日本語)
品質管理,分子系統解析,微細藻類
キーワード(英語)
quality control, molecular phylogenetic analysis, microalgae

研究概要

藻類保存株が,研究材料としてより多くの研究者に利用されるためには,分類学的評価,DNA配列情報や株特性の付加など,保存株の付加価値の向上が必要となる。そこで,保存株の18S,16Sリボゾーム遺伝子等の塩基配列の解析,およびそれらのデータベースへの登録,株利用文献調査や独自の解析による株特性の付加等を行い,より信頼性,利便性の高いコレクションをめざす。

研究の性格

  • 主たるもの:モニタリング・研究基盤整備
  • 従たるもの:基礎科学研究

全体計画

毎年,一定数の保存株について,塩基配列情報を独自に解析,あるいは,株特性を株を用いた論文等から収集し,それらの情報を保存施設のホームページ上に展開する保存株情報に追加する。また,それらの塩基配列データより系統樹を構築し,ホームページ上に公開する。

今年度の研究概要

引き続き18Sリボゾーム遺伝子を用いた分類学的再同定を行うとともに、これまでに登録した遺伝子情報をもちいた緑藻類等の系統樹をホームページに公開する。

備考

0507AD816

関連する研究課題
  • 0 : 環境測定等に関する標準機関としての機能の強化

課題代表者

笠井 文絵

担当者