- 予算区分
- AN 所内公募B
- 研究課題コード
- 1515AN003
- 開始/終了年度
- 2015~2015年
- キーワード(日本語)
- ゲノム解析,シアノバクテリア,アオコ
- キーワード(英語)
- genome analyses, cyanobacteria, algal bloom
研究概要
アオコ形成シアノバクテリア Microcystis aeruginosa のうち,グループGに属するものは特に霞ヶ浦において優占することが知られている.昨年度配列決定したM. aeruginosa NIES-2549株に加え、新たに無菌化したグループG M. aeruginosa株について、次世代シーケンサーによりそのゲノム配列を決定し、グループG特異的な機能遺伝子の探索を行う.
研究の性格
- 主たるもの:基礎科学研究
- 従たるもの:応用科学研究
全体計画
新規に無菌化したグループG M. aeruginosa株を用いて次世代シーケンス解析を行う.出力された配列に対してアセンブル,アノテーションを行い,既知の M. aeruginosa ゲノムと比較することでグループG M. aeruginosaに特異的な機能遺伝子の探索を行う.
今年度の研究概要
新規に無菌化したグループG M. aeruginosa株を用いて次世代シーケンス解析を行う.出力された配列に対してアセンブル,アノテーションを行い,既知の M. aeruginosa ゲノムと比較することでグループG M. aeruginosaに特異的な機能遺伝子の探索を行う.
- 関連する研究課題
- 0 : 生物・生態系環境研究分野における研究課題